La forma mas sencilla de salvar todas las reglas que has configurado en IPTables fue con iptables-persistant, lo primero es instarlos con el siguiente comando.
Luego para salvar las reglas de iptables utilizas el siguiente comando.
Luego para cargar otra vez las reglas salvadas (por ejemplo despues de reiniciar el sistema) ejecutamos el siguiente comandos.
Guardar las reglas IPTables en Ubuntu 16.04
Para Ubuntu 16.04 los comandos a ejecutar para guardar y cargar las reglas de iptables son los siguientes.
Cargar iptables-persistent entre reinicios
Para que estos cambios se carguen entre reinicios una forma bastante sencilla es hacerlo en el archivo de crontab, para esto ejecuta el siguiente comando.
Y agrega lo siguiente al final de dicho archivo y grabalo, con esto se cargaran las reglas que salvaste entre cada reinicio de forma automática.
@reboot sudo netfilter-persistent reload &