Cuando ingresas a ver el Mapa de Nagios puedes escoger diferentes layouts el tema es que al reiniciar la pagina volverás al que Nagios trae por defecto y puede ser que ese no sea tu preferido.
Para escoger un layout por defecto debes editar el archivo /usr/local/nagios/etc/cgi.cfg y buscar el texto siguiente.
default_statusmap_layout=6
Donde el numero al final de la linea indica el layout, te puedes orientar con el siguiente listado.
Value Layout Method
0 User Supplied
1 Depth Layers (Horizontal)
2 Collapsed Tree (Horizontal)
3 Balanced Tree (Horizontal)
4 DO NOT USE
5 Circular Markup
6 Circular Balloon
7 Balanced Tree (Vertical)
8 Collapsed Tree (Vertical)
9 Depth Layers (Vertical)
10 Force Map
Luego de colocar el numero de tu layout de preferencia debes reiniciar el demonio de Nagios y Apache.